Свою историю кафедра ведет с января 1972 г. Первым ее руководителем был кандидат юридических наук, доцент В.Д. Пакутин. В последующие годы кафедрой уголовно-правовых дисциплин заведовали В.А. Банин, доктор юридических наук, профессор Л.Л. Каневский. В 1991 г. кафедра уголовного права, процесса и криминалистики была разделена на две – кафедру уголовного права и процесса и кафедру криминалистики и судебных экспертиз. С этого момента и по 2010 г. руководство кафедрой уголовного права и процесса осуществлял доктор юридических наук, профессор З.Д. Еникеев, с 2010 г. – кандидат юридических наук Е.Г. Васильева. С 2012 г. кафедру возглавляет доктор юридических наук, профессор А.А. Тарасов.
Большую роль в развитии кафедры и подготовке юристов высшей квалификации сыграли участники Великой Отечественной войны заслуженные юристы РФ и РБ, начавшие свою трудовую деятельность в правоохранительных органах республики, доценты Ф.Г. Гилязев, В.А. Банин и старший преподаватель Н.А. Вершинин.

Огромный вклад в развитие кафедры внес доктор юридических наук, профессор З.Д. Еникеев (1932-2011 г.г.), известный в России и далеко за ее пределами ученый, почетный профессор Башкирского государственного университета, заслуженный юрист РФ и РБ, заслуженный деятель науки РБ, отличник высшей школы СССР, почетный работник высшего профессионального образования России. Несмотря на огромную занятость, он всегда оставался внимательным и доброжелательным, щедро делился огромным жизненным опытом, чутко и бережно относился к достижениям своих коллег и учеников, в числе которых доктора и кандидаты юридических наук.
Много лет преподавательской работе отдал кандидат юридических наук, профессор В.Д. Пакутин (1930-2022). Его занятия, проводимые на высочайшем профессиональном уровне, всегда пользовались огромным успехом у студентов и многим из них помогли найти собственный путь к успешной профессиональной карьере, в том числе и в научной деятельности.

Сегодня кафедра объединяет активных, целеустремленных, творческих преподавателей. Созданная профессорами З.Д.Еникеевым и В.Д.Пакутиным научная школа широко известна за пределами Республики Башкортостан своими опубликованными научными трудами и постоянным активным участием в академической жизни России. Представители кафедры уголовного права и процесса Уфимского университета науки и технологий (до 2022 года – Башкирского государственного университета) входят в состав диссертационных советов, созданных на базе ведущих учебных заведений страны, приглашаются для участия в защите кандидатских и докторских диссертаций в качестве официальных оппонентов в диссертационных советах, работающих в Москве, Санкт-Петербурге, Екатеринбурге, Волгограде, Томске, Самаре и т.д. Известность уфимской юридической научной школы обеспечивает участие Уфимского университета науки и технологий в защитах кандидатских и докторских диссертаций по специальности 5.1.4 – уголовно-правовые науки в качестве ведущей организации. Научная школа кафедры в настоящее время активно пополняется новыми перспективными молодыми кадрами.
Кафедра является организатором международных, российских и региональных научно-практических конференций и круглых столов. Кафедра активно участвует в реализации университетской программы «Приглашенный профессор»: открытые лекции и мастер-классы в Уфе проводили многие видные ученые, представляющие известные научные школы разных регионов России.

Совместно с кафедрой криминалистики кафедра курирует уголовно-правовой профиль, поэтому наряду с теоретической подготовкой большое внимание уделяется практическому обучению студентов. Кафедра тесно сотрудничает со Следственным комитетом РБ, МВД РБ, Прокуратурой РБ, Управлением Судебного департамента в РБ, Верховным судом РБ, Государственным комитетом РБ по делам юстиции, Управлением федеральной службы судебных приставов, Государственным комитетом РБ по молодежной политике, Башкортостанским отделением Общероссийской общественной организации «Ассоциация юристов России». В рамках этого сотрудничества студенты прикрепляются к опытным практикам в качестве общественных помощников, оказывают квалифицированную юридическую помощь социально незащищенным и малоимущим гражданам. В институте организовываются встречи с выпускниками, работающими в этой системе, с их участием на студенческих собраниях обсуждаются вопросы учебного процесса. К ведению учебных занятий привлекаются практические работники.

Преподаватели кафедры представляют общественность в различных коллегиальных органах. Так, кандидат юридических наук, доцент Р.М. Шагеева является членом Экзаменационной комиссии Республики Башкортостан по приему квалификационного экзамена на должность судьи; кандидат юридических наук, профессор М.Б. Кострова – член Комиссии по соблюдению требований к служебному поведению федеральных государственных гражданских служащих аппаратов Верховного суда РБ, Арбитражного суда РБ, межрайонных, районных, городских судов Республики Башкортостан, Уфимского гарнизонного военного суда, Управления Судебного департамента в РБ и урегулированию конфликта интересов.
Совместно с кафедрой криминалистики кафедра уголовного права и процесса открыла первую в Институте права программу магистратуры по направлению подготовки 40.04.01 Юриспруденция, направленность подготовки «Уголовное право, уголовный процесс и криминалистика». Сейчас кафедрами реализуется магистерская программа «Юрист в сфере уголовного судопроизводства». На кафедре действует аспирантура по научной специальности 5.1.4. «Уголовно-правовые науки». Под руководством преподавателей кафедры студенты, обучающиеся по уголовно-правовому профилю, традиционно занимают призовые места в студенческих олимпиадах, конкурсах студенческих научных работ разного уровня, в студенческих научных конференциях.